Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC4A5Q9BY07 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms