Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms