Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNHG12Q9BXW3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms