Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SALL3Q9BXA9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SALL3Q9BXA9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms