Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms