Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MESP1Q9BRJ9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms