Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
RETNLBQ9BQ08 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
RETNLBQ9BQ08 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms