Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PITX2Q99697 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms