Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms