Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIK3C3Q8NEB9 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms