Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HJURPQ8NCD3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms