Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMYD1Q8NB12 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms