Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms