Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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TMCO5AQ8N6Q1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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TMCO5AQ8N6Q1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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TMCO5AQ8N6Q1 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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TMCO5AQ8N6Q1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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TMCO5AQ8N6Q1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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TMCO5AQ8N6Q1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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TMCO5AQ8N6Q1 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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TMCO5AQ8N6Q1 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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TMCO5AQ8N6Q1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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TMCO5AQ8N6Q1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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TMCO5AQ8N6Q1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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TMCO5AQ8N6Q1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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