Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC141Q6ZP82 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms