Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPOCD1Q6ZMY3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms