Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
REEP3Q6NUK4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms