Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL2Q6F5E8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms