Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD40Q6AI12 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms