Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HES3Q5TGS1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms