Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZD1

C6orf141, Uncharacterized protein C6orf141, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf141Q5SZD1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms