Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTXN3Q4LDR2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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