Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDRF1Q3B7T1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EDRF1Q3B7T1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms