Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DDR2Q16832 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDR2Q16832 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms