Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLPPQ16740 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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