Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CTF1Q16619 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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CTF1Q16619 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CTF1Q16619 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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CTF1Q16619 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CTF1Q16619 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTF1Q16619 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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