Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ZNF239Q16600 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF239Q16600 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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