Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NTRK3Q16288 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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