Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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