Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB39AQ14964 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB39AQ14964 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms