Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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