Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FHL3Q13643 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms