Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD2Q13563 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD2Q13563 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD2Q13563 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD2Q13563 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD2Q13563 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD2Q13563 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD2Q13563 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD2Q13563 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD2Q13563 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD2Q13563 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD2Q13563 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD2Q13563 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD2Q13563 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD2Q13563 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2Q13563 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2Q13563 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2Q13563 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2Q13563 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2Q13563 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2Q13563 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2Q13563 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD2Q13563 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
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