Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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