Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
AP3B2Q13367 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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