Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX10Q12887 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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