Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2AQ12879 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2AQ12879 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
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