Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C2orf54Q08AI8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms