Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTDSPL2Q05D32 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms