Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFAMQ00059 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms