Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA4AP68366 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA4AP68366 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms