Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKP1P63208 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKP1P63208 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SKP1P63208 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKP1P63208 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKP1P63208 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SKP1P63208 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKP1P63208 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKP1P63208 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKP1P63208 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP1P63208 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP1P63208 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP1P63208 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP1P63208 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP1P63208 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP1P63208 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP1P63208 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP1P63208 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP1P63208 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP1P63208 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP1P63208 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP1P63208 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP1P63208 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP1P63208 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP1P63208 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP1P63208 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP1P63208 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKP1P63208 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms