Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX2P58304 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX2P58304 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX2P58304 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX2P58304 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX2P58304 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX2P58304 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VSX2P58304 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VSX2P58304 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VSX2P58304 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms