Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NRG3P56975 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NRG3P56975 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NRG3P56975 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NRG3P56975 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms