Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HK3P52790 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HK3P52790 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HK3P52790 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HK3P52790 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HK3P52790 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HK3P52790 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HK3P52790 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HK3P52790 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HK3P52790 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HK3P52790 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HK3P52790 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HK3P52790 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms