Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT2P45379 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms