Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNA4P43681 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms