Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBRP36941 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBRP36941 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBRP36941 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms