Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD13P35453 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms