Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SPRR1AP35321 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms